THORAX |公共卫生学院李迎君团队首次系统鉴定与特发性肺纤维化(IPF)存在因果关联的血浆蛋白
2024年8月19日,杭州医学院公共卫生学院李迎君课题组在国际权威期刊《THORAX》(中科院一区,IF=10.8)上在线发表了题为“Genetic-informed proteome-wide scan reveals potential causal plasma proteins for idiopathic pulmonary fibrosis”的研究论文。
本研究研究创新性地整合人类基因组学与血浆蛋白质组学大数据,首次系统鉴定了与特发性肺纤维化(IPF)存在因果关联的血浆蛋白,为这一致死性疾病的机制研究和靶向治疗提供了重要线索。
IPF是一种病因不明的进行性致死性肺疾病,五年生存率低于30%。尽管既往研究已发现部分遗传风险位点,但可靠的生物标志物和有效治疗靶点仍然缺乏。循环蛋白质作为潜在的生物标志物和治疗靶点的重要来源,其与IPF的因果关系尚不明确。
研究团队采用孟德尔随机化(MR)这一因果推断方法,整合了国际IPF遗传联盟(4,125例病例)和全球生物银行(6,257例病例)的遗传数据,以及冰岛和英国人群血浆蛋白质组数据(涵盖2,769种血浆蛋白)。通过严格的统计分析,研究发现ADAM15、FUT3和USP28三种血浆蛋白水平与IPF风险存在显著因果关联(FDR<0.05),其中ADAM15显示出最强的关联证据。研究团结进行多维度验证,共定位分析证实这三种蛋白与IPF共享相同的致病遗传位点,ADAM15的遗传变异在肺组织和血液中均显示出显著的表达调控效应,以及单细胞RNA测序显示ADAM15主要在肺内皮细胞中表达,且在IPF患者中表达降低。
本研究首次通过蛋白质组范围的因果分析,系统鉴定了特发性肺纤维化(IPF)的潜在致病血浆蛋白。这些发现为理解IPF的发病机制提供了新视角,特别是ADAM15作为金属蛋白酶家族成员,可能通过调控内皮细胞功能参与IPF进程,这为后续机制研究和靶向治疗开发指明了方向。
杭州医学院学生朱家豪为本论文的第一作者,杭州医学院李迎君副教授与浙江省疾控中心俞敏主任医师为共同通讯作者。杭州医学院为本论文第一和通讯作者单位。本研究获得杭州医学院公共卫生与预防医学一流学科,浙江省自然科学基金(LTGY231260009)和浙江省医药卫生科技计划(WKJ-ZJ-2333)支持。
原文链接:
https://thorax.bmj.com/content/79/9/878.long