学校建有1个高等级生物安全实验室，6个全省重点实验室（全省肿瘤分子诊断与个体化治疗研究重点实验室、全省头颈肿瘤精准医学研究重点实验室、全省眼病精准医疗重点实验室、全省高等级生物安全与生物医药转化重点实验室、全省炎性慢病药物发现与安评技术研究重点实验室、全省神经系统疾病数智化康复装备研发重点实验室），6个省工程研究中心（消化道肿瘤诊疗与药物研发浙江省工程实验室、新型疫苗浙江省工程研究中心、检验诊断关键技术浙江省工程研究中心、数智化康复装备浙江省工程研究中心、脑认知与疾病数字医疗器械浙江省工程研究中心、炎性慢病新药研发浙江省工程研究中心），1个博士后科研工作站。建有国家药品监督管理局药物GLP认证机构、国家甲型肝炎减毒活疫苗毒种保存中心、浙江省实验动物管理办公室等多个科技服务平台。传染病疫苗药物概念验证中心入选省级概念验证中心建设布局清单。2018年以来，获得省部级及以上科研项目713项，其中国家级科研项目260项，省部级及以上成果奖励21项，国家授权专利1223项，在国内外高水平的学术刊物上年均公开发表论文超过500篇。公开出版发行《国际流行病学传染病学杂志》《浙江实用医学》《浙江医学教育》等学术期刊。